Osakond vastutab EIP Grupis sisekontrollisüsteemide ning riskijuhtimisega seotud menetluste asjakohasuse ja tõhususe kontrollimise ja hindamise eest. Selleks vaatab siseauditi osakond rotatsiooni alusel ja riskipõhist lähenemisviisi kasutades läbi ja testib kontrollimehhanisme kriitilise tähtsusega pangandus-, infotehnoloogia- ja haldusvaldkondades.