Ģenerālinspektorāts atbilstīgi ģenerālinspektora pilnvarām apvieno trīs neatkarīgas pārskatatbildības funkcijas: EIB grupas darbību izvērtēšanu, aizliegtas rīcības izmeklēšanu un sūdzību izskatīšanas mehānismu. Turklāt ģenerālinspektors vada EIB iepirkumu sūdzību komiteju, kas izskata sūdzības par iepirkumiem.